Depois da preparação do paciente para o procedimento, o primeiro passo efetivo do transplante é a destruição das células medulares doentes por meio de quimioterapia e/ou radioterapia, o que causa perda total de imunidade. As novas células, sadias, são então incorporadas no paciente da mesma forma como acontece em uma transfusão de sangue: são injetadas diretamente na corrente sanguínea. Portanto, não é necessário nenhum procedimento cirúrgico.
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